miniconda安装使用记录

1.安装miniconda

• 看到了个博客的提示，说最好不要追新，所以选择了使用3.8版本支持的miniconda版本，之后是安装过程

1.安装miniconda

懒得说，查的百度

2.配置环境

1. 创建3.8环境

conda create --name py38 python=3.8

命令使用时如果报错：CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url <https:......
把设置镜像时设置的链接的所有https改成http即可
（可直接更改.condarc文件）

2. 激活指定的环境

查看当前环境列表： conda info --envs
更换环境：conda activate py38

3.conda常用命令

1、指定安装软件的版本（以fastqc为例）

在不指定版本的情况下，conda默认安装该软件的最新版，如果要安装旧的版本方法：

先看看有哪些可以安装的版本conda search fastqc

安装指定版本的软件

conda install fastqc=0.11.7

2、查看conda中已经安装的软件

conda list     #查看当前环境下用conda安装的软件

conda list fast*   # 查看符合正则表达式的软件

conda list -n base    # 查看指定环境下用conda安装的软件

3、删除软件

conda remove fastqc   # 删除该环境中的软件

conda remove -n rnaseq fastqc   # 删除指定环境下的软件

4、升级软件

conda update fastqc  #升级指定的软件

conda update conda    #升级conda本身

补充：

conda可以一次安装多个软件包；

有时候只要软件比如说我们的conda不影响我们的使用就不需要去管；

指定下载该软件的旧版本就可以完成该软件的降级。 作者：笨笨熊爱吃肉 https://www.bilibili.com/read/cv16360139 出处：bilibili

4.安装jupyter

1. 安装jupyter

   pip install jupyter -i http://pypi.douban.com/simple --trusted-host pypi.douban.com

2. 使用：

   jupyter notebook